对于一个无尘车间，首先要根据实际生产过程设置相应的功能室，并考虑人流的方向和操作的效率。在初步确定平面方案的基础上，确定洁净区和非洁净区，以及洁净区的洁净度等级。然后确定相应的换气次数或截面风速。然后布置回风口，规划洁净风机组（尺寸、方向、风机和空调选型等）、规划送回新风风道等。
1、无尘车间的布局
无尘车间一般包括无尘区、准无尘区和辅助区三部分。无尘车间可以有以下平面放置方法：
外廊盘绕式：阳台可以有窗也可以没有窗，也可以用来观赏和放置一些设备，有的在阳台上直接加热。外窗必须是双层密封窗。
内廊式：无尘车间设置在外围，走廊设置在里面。这种走廊的清洁度普遍较高，甚至与无尘车间相当。
两端式：一侧设置无尘区，另一侧设置准无尘室和辅助室。
中心型：为节约用地、缩短管道，以无尘区为中心，上下两侧为各种辅助房和遮阳管道空间。这种方法避免了室外气候对无尘区的影响，降低了冷热能耗，有利于节能。
2、人员清扫道路
为尽量减少操作过程中人为活动造成的污染，人员进入洁净区前需更换干净衣服、洗手、消毒、喷洒。这些措施是人员净化。
人员净化室更换干净衣物的房间应有空气供应，其他房间如入口侧应保持正压，卫生间和淋浴间应保持少量正压，负压厕所和淋浴间应保持压力。
3、物料净化之路
各种物体在被送入洁净区之前需要通过。
物料净化路与人体清洁路应分开。如果物料和人只能在同一个地方进入无尘车间，也需要分开进入，而且物料要先经过粗提纯处理。
对于生产线不强的场合，可在料路中央设置中央仓库。
如果生产线很强，则采用直通式料路，有时需要在直通道的中央设置多台净化输送设备。
在系统规划上，由于洁净室在粗、细净化阶段会吹走大量的颗粒物，因此在相对无尘的区域应保持负压或零压。如果污染风险高，进口方向也应该是负压。
4、管道组织
无尘车间的管道非常复杂，因此这些管道采用隐藏组织方法。有几种方法可以进行详细的隐蔽组织。
(1)技能夹层
一、顶部技能夹层。在这种夹层中，送回风管道的横截面一般是最大的，因此是夹层中的首要考虑因素。它一般组织在解剖顶部，电气管道组织在其下方。当这种夹层的底板可以接受某种元件时，可以在其上设置过滤器和排气设备。
二、房间技能夹层。与顶部夹层相比，这种方法可以减少夹层的布线和高度，并且可以节省回风管道返回上层夹层所需的技巧通道。在过道中还可以设置回风轮动力设备的配电等。某一层无尘车间的上过道也可以作为上层的下过道。
(2)技能车道（墙）
上下夹层的水平管道一般要改成垂直管道。垂直管道位置的阴影空间为技术车道。技能溜槽还可以放置一些不适合无尘车间的辅助设备，甚至可以作为一般的回风道或静压箱使用，有的还可以装灯管状散热器。
由于这些技能夹层（墙）大多采用轻量级间隔，在工艺调整时可以轻松调整。
5、技能轴
如果技能路径（墙）经常不穿过地板，则在需要穿过地板时使用技能竖井，它通常用作建筑结构的一部分，是永久性的。
由于技能井串联各楼层，为防止火灾，内部管道安装完毕后，楼层应采用耐火等级不低于楼板的材料进行封闭。维修工作分层进行，维修门必须设置防火门。
无论是技能夹层、技能通道还是技能轴，直接作为气道使用时，其内外外观都必须按照无尘车间的要求进行处理。
6、机房的位置
空调房最好靠近需要大量送风量的无尘车间，力求风管线路最短。但在避免噪音和震动方面，需要无尘车间与机房分开。
7、安全去中心化
由于无尘车间是一个高度密闭的建筑，它的安全分散成为一个非常重要和突出的问题，这也与净化空调系统的设置密切相关。一般应注意以下几点：
(1)生产车间的每个防火区或无尘区应至少设置2个安全出口。只要面积小于50平方米，人员数量小于5人，只能约定一个安全出口。
(2)进口不应分散出口。由于道路往往曲折蜿蜒，一旦烟花铺天盖地，就很难要求人员快速跑到户外。
(3)吹淋室不能作为一般收支渠道。因为这种门往往是两个联锁或活动的，一旦出现问题，就会大大影响分散。因此，旁通门一般设置在吹瓶间，操作人数多于5人。通常，操作员在离开无尘车间时应该穿过旁通门而不是吹风机淋浴间。
(4)每个无尘车间的门，考虑到保持房间内压力的需要，应朝压力高的房间方向开启。由于需要通过压力将门压紧，这显然有悖于安全和分散的要求。为考虑普通无尘紧急分散的要求，将常规无尘区与非无尘区、无尘区与室外门之间的门作为安全分散门处理，他们的开放方向，都是朝着分散的方向。当然，单设安全门也是如此。