两联供系统中的管道含水管道和空气管道。
水管道系统：在水力输配管道系统中，调节的内容包括以下几部分：管道直径：管道直径的选择既要考虑要降低成本(尽量使用小管径)也要考虑满足所有末端额定流量(管径不能太小)。另外，不同管件的阻力相差很大，应该采用合理的管道体系既便于安装、阻力又不大：
水力平衡：多种末端安装在同一个水泵回路，如果水力不平衡会出现偏流的情况发生，偏流后就会造成流量的末端供冷热量不足、效果不好。
水箱：接入辐射热源、实现二次系统、便于排气、制冷热量缓冲、化霜缓冲；
压差旁通：对一次系统，由于热泵主机有最小流量要求，因此在末端开启少的情况下，压差旁通阀保证和这个流量要求；
5）变流量：不同数量末端开/关时，特定末端的流量也会发生变化，使用自适应泵或定流量阀，可保证末端的流量稳定；
6）混水调温：末端需要不同的供水温度时，可使用混水泵站或混水中心获得要求的供水温度。
以上内容被称作“水力设计”。两联供系统设计包括方案设计和系统设计，其中系统设计包括水力系统、空气系统和控制系统设计，水力设计是水力系统设计的一部分，除水力设计外，两联供系统设计还包括：主机和末端选型设计。
水力输配管道的设计要考虑系统使用要求，灵活使用水箱、压差旁通阀、管道安装方式、自适应泵、混水部件等，保证每个末端在全部使用工况下都能正常使用，避免出现不正常的工况和故障。
目前市场上水力输配管道供应链很混乱，多个厂家供货，而且许多产品不能相互匹配，因此导致很多售后服务问题。现推荐使用“水力管道体系”来解决这个问题。
水力部件中出现的主要部件见下表，其中一些部件需要经过设计选型后才能确定型号和参数。
空气管道系统：分为顶送(圆)管道和地送《扁)管道体系两种。但基本原则是一样的，也就是根据风量大小来选择合适的管道直径，建议选择分风箱把风量分配给小管道，每个小管道的长度基本一致，这样就保证了每根管道的风量基本一致。理论计算和实际经验都表明，最小风管(75双壁波纹管和*31mm的扁管道)的保证风量是30mh，设备额定风量除以30也就是最少布置管道数量。比如标称m/h的机组，其最小布置管道数是/30=11.7，也就是最少布置12根管道。地送风风口一般可以接1-3根风管，而顶送风风口一般接1-2根风管。其风量是单根风管的倍数。在管道体系中，风量小于m/的空气处理机其出风口一般为圆形，大于m/h的空气处理机其出口为矩形。出风口的风速一般要高于正常管道中的风速。在设备的出风口一般要安装2m左右的消音风管以降低风机噪音。
目前住宅内的送风方式分为顶装和地装。分风箱的方式应该是一种比较合理的风量分配方式。但分风箱还需要对各个管道的风量进行调节，这个调节应该尽量远离风口的地方进行，以避免局部气流速度过大导致声响。
送风管道的阻力与送风量的平方成正比，不允许在新风机出口缩径布管。为减少新风机尺寸，新风机的机外余压一般都不大(Pa左右)，而送风距离往往在20cm以上。以前主管道分支管的安装方式需要反复核算及现场精确调节，工作难度大，很难推广使用。